Science.com - "BIOLOGY - New dangers? Computers uncover 100,000 novel viruses in old genetic data
Clues to future outbreaks may be hidden in existing genomic databases"
Science.com - "NACHRICHTEN BIOLOGIE - Neue Gefahren? Computer entdecken 100.000 neuartige Viren in alten genetischen Daten
Hinweise auf zukünftige Ausbrüche könnten in bestehenden Genomdatenbanken verborgen sein"
"26 JAN 202211:50 AMBYELIZABETH PENNISI
Es brauchte nur einen Virus, um die Weltwirtschaft lahmzulegen und Millionen von Menschen zu töten; Dennoch schätzen Virologen,
dass es Billionen noch unbekannter Viren gibt, von denen viele tödlich sein könnten oder das Potenzial haben, die nächste Pandemie
auszulösen. Jetzt haben sie eine neue – und sehr lange – Liste möglicher Verdächtiger, die verhört werden können. Durch die Durchsicht
beispielloser Mengen vorhandener Genomdaten haben Wissenschaftler mehr als 100.000 neue Viren entdeckt, darunter neun Coronaviren
und mehr als 300 mit dem Hepatitis-Delta-Virus verwandte Viren, die Leberversagen verursachen können.
[...]
[...] der Computerbiologe Artem Babaian [...]. [...] war [...] einfach neugierig, wie viele Coronaviren – abgesehen von dem Virus, das
gerade die COVID-19-Pandemie ausgelöst hatte – in Sequenzen in bestehenden genomischen Datenbanken gefunden werden könnten.
[...] Also durchsuchten er und der unabhängige Supercomputing-Experte Jeff Taylor Cloud-basierte Genomdaten, die in einer globalen
Sequenzdatenbank hinterlegt und von den US National Institutes of Health hochgeladen worden waren. [...]
[...]
Babaians Ansatz war schnell genug, um 1 Million Datensätze pro Tag zu bearbeiten – bei Rechenkosten von weniger als 1 Cent pro
Datensatz. „Das ist eine beeindruckende technische Meisterleistung“, sagt C. Titus Brown, Bioinformatiker an der University of California,
Davis, der nicht an der Studie beteiligt war. Als die Forscher endlich fertig waren, hatten sie die Teilgenome von fast 132.000 RNA-Viren
freigelegt , berichten sie heute in Nature.
Die neue Datenbank der Gruppe enthält nicht die vollständige Sequenz jedes neuen Virus – in vielen Fällen gibt es nur das Gen für das
Kernenzym. Aber Forscher können sogar Teilsequenzen verwenden, um Stammbäume zu erstellen, die zeigen, wie verschiedene Viren
verwandt sind und wie sie sich entwickeln. Sie können die Datenbank auch verwenden, um herauszufinden, wo ein bestimmter Virus
gefunden wurde – und was sein Wirt ist. Und einige Entdeckungen könnten Forschern helfen, besser zu verstehen, wie menschliche
Krankheitserreger entstehen, sagt Brown, oder diagnostische Tests für Virusinfektionen verbessern. Wenn schließlich ein neues Virus
von einem kranken Patienten isoliert wird, können Forscher leichter feststellen, ob es bereits anderswo gefunden wurde. „Wir haben
diese [Datenbank] in ein riesiges Virenüberwachungsnetzwerk verwandelt“, sagt Babaian.
[...]
Um sicherzustellen, dass andere von der Arbeit profitieren können, hat das Team von Babaian ein öffentliches Repository der von ihm
entwickelten Tools zusammen mit den Ergebnissen erstellt. Die Menge an Cloud-basierten, öffentlich zugänglichen DNA-Sequenzen
wächst exponentiell; Wenn er nächstes Jahr die gleiche Analyse durchführte, würde Babaian erwarten, hunderttausende weitere
RNA-Viren zu finden. „Bis zum Ende des Jahrzehnts möchte ich über 100 Millionen identifizieren.“
Siehe vollständig dazu die Quelle im englischen Original unter
https://www.science.org/content/article/...&et_cid=4088851
Kommentar
Ich denke, die Frage der Beitragsüberschrift hat sich im Artikel von selbst beantwortet.
Diese unglaubliche Arbeit eröffnet bislang ungeahnte Möglichkeiten Viren zu entdecken,
zu bestimmen und deren Entwicklung in begrenztem Umfang vorherzusagen sowie die
bestehenden und erkannten Viren zu überwachen, etc., was trotz der stets vorhandenen
Möglichkeit unvorhersehbarer Mutationen einen extrem großen Schritt in Richtung des
besseren Verständnisses einer bislang nur wenig erforschten "Lebensform" bedeutet.
Dabei ist darauf hinzuweisen, dass Viren allein nicht lebensfähig sind und keinen eigenen
Stoffwechsel besitzen, also genau genommen selbst nicht "leben", sondern sich, anders
als beispielsweise Bakterien, nur über einen Wirt weiter vermehren können.